In Zukunft wird zwischen Düren und Bonn-Oberkassel die S-Bahn-Linie S 13 verkehren. Mit ihr verbessert sich die Verbindung zwischen Köln und Bonn gegenüber heute deutlich. Zudem erhalten die Stadt Bonn und der Rhein-Sieg-Kreis zusätzliche Direktverbindungen zum Flughafen Köln/Bonn. Rund 750 Millionen Euro nehmen der Bund und das Land NRW für diese neue S-Bahn-Verbindung in die Hand.
Um die S-Bahn nach Bonn verlängern zu können, muss der 13 Kilometer lange Abschnitt zwischen Troisdorf und Bonn-Oberkassel ausgebaut werden. Zahlreiche Brücken sowie Unter- und Überführungen werden erneuert, neu gebaut oder ersetzt. Eng an der bestehenden Strecke werden größtenteils zwei neue S-Bahn-Gleise verlegt.
Vier vorhandene Haltepunkte und Bahnhöfe werden modernisiert und barrierefrei gestaltet. Zusätzlich entstehen die neuen Haltepunkte „Bonn-Ramersdorf“ und „Bonn-Vilich“. Entlang der Strecke sind unter anderem 15 Kilometer an Schallschutzwänden sowie passive Schallschutzmaßnahmen vorgesehen.
Der Abschnitt Troisdorf – Bonn-Oberkassel wird aktuell von der Regionalbahnlinie RB 27 und dem Regional-Express RE 8 bedient, die jeweils einmal in der Stunde fahren. Unter anderem im Abschnitt Düren – Troisdorf fährt zurzeit die S 19. In Zukunft wird die neue S 13 im 20-Minuten-Takt durchgängig zwischen Düren, Köln und Bonn-Oberkassel unterwegs sein und den RE 8, die RB 27 sowie die S 19 ergänzen.